Изучение локусов, ассоциированных с остеоартитом, по результатам полногеномных исследований (GWAS) у женщин из Республики Башкортостан


DOI: https://dx.doi.org/10.18565/therapy.2019.7.91-96

Д.А. Шаповалова, А.В. Тюрин, Р.И. Хусаинова

1) ФГБНУ «Институт биохимии и генетики» Уфимского Федерального исследовательского центра Российской академии наук, г. Уфа; 2) ФГБОУ ВО «Башкирский государственный медицинский университет» Минздрава России, г. Уфа
Цель исследования – изучить ассоциации полиморфных вариантов rs4836732 (ASTN2), rs1298744 и rs2302061 (DOT1L), rs3204689 (ALDH1A2), rs6976 (GLT8D1), rs11177 (GNL3), rs6094710 (NCOA3), rs11841874 (MCF2L), rs7639618 (DVWA) с формированием предрасположенности к ОА у женщин из Республики Башкортостан, учитывая локализацию патологического процесса, возраст дебюта заболевания и наличие признаков нДСТ как в коморбидном, так и изолированном состояниях.
Материал и методы. Проведено репликативное исследование полиморфных локусов, ассоциированных по результатам полногеномного анализа ассоциаций (GWAS) в генах ASTN2, DOT1L, ALDH1A2, GLT8D1, GLN3, NCOA3, MCF2L, DVWA, у 256 женщин c OA и 161 контроля из Республики Башкортостан.
Результаты. Выявлена значимость локусов rs2302061 (DOT1L), rs7639618 (DVWA), rs4836732 (ASTN2), rs6976 (GLT8D1), rs3204689 (ALDH1A2) в формировании предрасположенности к ОА в целом, а также с учетом наличия признаков нДСТ, возраста дебюта заболевания и локализации патологического процесса.
Заключение. Приведенные результаты исследования имеют определенное значение для изучения генетических факторов ОА как в изолированном, так и в коморбидном с нДСТ вариантах, однако из-за противоречивости полученных данных необходима дальнейшая их валидация на независимых выборках.
Ключевые слова: гены предрасположенности, полногеномные исследования, остеоартрит, полиморфизм
Полный текст статьи доступен
в "Библиотеке Врача"

Литература

  1. Nelson A.E. Osteoarthritis year in review 2017: clinical. Osteoarthritis Cartilage. 2017; 26(3): 319–25.

  2. Vina E.R., Kwoh C.K. Epidemiology of Osteoarthritis: Literature Update. Curr Opin Rheumatol. 2018; 30(2): 160–67.

  3. Балабанова Р.М., Дубинина Т.В., Демина А.Б., Кричевская О.А. Заболеваемость болезнями костно-мышечной системы в Российской Федерации за 2015–2016 гг. Научно-практическая ревматология. 2018; 56(1): 15–21.

  4. Yucesoy B., Charles L.E., Baker B., Burchfiel C.M. Occupational and genetic risk factors for osteoarthritis: a review. Work. 2015; 50(2): 261–73.

  5. Нечаева Г.И., Яковлев В.М., Конев В.П., Друк И.В., Морозов С.Л. Дисплазия соединительной ткани: основные клинические синдромы, формулировка диагноза, лечение. Лечащий врач. 2008; 2: 22–28.

  6. Яковлев В.М., Нечаева Г.И. Системные дисплазии соединительной ткани: актуальность проблемы в клинике внутренних болезней. Сибирский медицинский журнал. 2011; 26: 9–13.

  7. Кадурина Т.И., Аббакумова Л.Н. Оценка степени тяжести недифференцированной дисплазии соединительной ткани у детей. Медицинский вестник Северного Кавказа. 2008; 2(10): 15–20.

  8. Кадурина Т.И., Горбунова В.Н. Дифференцированная и недифференцированная дисплазия соединительной ткани. Дисплазия соединительной ткани: руководство для врачей. СПб.: ЭЛБИ. 2009; 704.

  9. Земцовский Э.В. Недифференцированные дисплазии соединительной ткани. Попытка нового осмысления концепции. Медицинский вестник Северного Кавказа. 2008; 2(10): 8–14.

  10. Wang T., Liang Y., Li H. et al. Single nucleotide polymorphisms and osteoarthritis an overview and a meta-analysis. 2016; 95(7): 1–13.

  11. Rodriguez-Fontenla C., Gonzalez A. Genetics of osteoarthritis. Reumatol Clin. 2015; 11(1): 33–40.

  12. arcOGEN Consortium, arcOGEN Collaborators. Identification of new susceptibility loci for osteoarthritis (arcOGEN): a genome-wide association study. Lancet. 2012; 380: 815–23.

  13. Castano Betancourt M.C., Cailotto F., Kerkhof H.J. et al. Genome-wide association and functional studies identify the DOT1L gene to be involved in cartilage thickness and hip osteoarthritis. Proc Natl Acad Sci USA. 2012; 109(21): 8218–23.

  14. Miyamoto Y., Shi D., Nakajima M. et al. Common variants in DVWA on chromosome 3p24.3 are associated with susceptibility to knee osteoarthritis. Nat Genet. 2008; 40: 994–98.

  15. Evangelou E., Kerkhof H.J., Styrkarsdottir U. et al. A meta-analysis of genome-wide association studies identifies novel variants associated with osteoarthritis of the hip. Ann Rheum Dis. 2014; 73(12): 2130–36.

  16. 1Behesti H., Fore T.R., Wu P. et al. ASTN2 modulates synaptic strength by trafficking and degradation of surface proteins. PNAS. 2018; 115(41): 9717–26.

  17. Styrkarsdottir U., Thorleifsson G., Helgadottir H.T. et al. TREAT-OA Consortium; arcOGEN Consortiuml. Severe osteoarthritis of the hand associates with common variants within the ALDH1A2 gene and with rare variants at lp31. Nat Genet. 2014; 46(5): 498–502.

  18. Shepherd C., Zhu D., Skelton A.J. et al. Functional characterization of the osteoarthritis genetic risk residing at ALDH1A2 identifies rs12915901 as a key target variant. Arthritis Rheumatol. 2018; 70(10): 1577–87.

  19. Panoutsopoulou K., Zeggini E. Advances in osteoarthritis genetics. J Med Genet. 2013: 50(11): 715–24.


Об авторах / Для корреспонденции

Дарья Алексеевна Шаповалова, м.н.с. лаборатории молекулярной генетики человека Института биохимии и генетики – обособленного структурного подразделения УФИЦ РАН. Адрес: 450054, г. Уфа, пр. Октября, д. 71,
лит. 1Е. Тел.: 8(347)235-60-88; 8 (917) 430-54-41. E-mail: daria-ufa92@mail.ru
Антон Викторович Тюрин, к.м.н., зав. кафедрой госпитальной терапии №2 ФГБОУ ВО «Башкирский государственный медицинский университет» Минздрава России. Адрес: 450008, г. Уфа, ул. Ленина, д. 3. Тел.: 8 (927) 994-00-35. E-mail: anton.bgmu@gmail.com
Рита Игоревна Хусаинова, д.б.н., в.н.с. лаборатории молекулярной генетики человека Института биохимии и генетики – обособленного структурного подразделения УФИЦ РАН. Адрес: 450054, г. Уфа, пр. Октября, д. 71,
лит. 1Е. Тел.: 8 (347) 235-60-88; 8 (987) 145-77-18. E-mail: ritakh@mail.ru


Похожие статьи

К содержанию номера

Бионика Медиа