Анализ распространенности первичной резистентности ВИЧ-1 к антиретровирусным препаратам в Новосибирской области
DOI: https://dx.doi.org/10.18565/therapy.2022.3.35-41
Д.В. Капустин, Е.И. Краснова, М.Р. Халиков, Л.Л. Позднякова, Н.И. Хохлова, Л.В. Максименко, В.Е. Екушов, А.В. Тотменин, Н.М. Гашникова
1) ФГБОУ ВО «Новосибирский государственный медицинский университет» Минздрава России;
2) ГБУЗ Новосибирской области «Городская инфекционная клиническая больница № 1», г. Новосибирск;
3) ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии Вектор» Роспотребнадзора, р.п. Кольцово, Новосибирская область
Аннотация. Своевременное выявление вариантов ВИЧ, устойчивых к антиретровирусным препаратам (АРП), и коррекция линии терапии позволяют предотвратить формирование мутаций.
Цель – изучить распространенность первичной резистентности ВИЧ-1 к АРП у больных с ВИЧ- инфекцией в Новосибирской области в 2021 г.
Материал и методы. Обследованы 119 больных с впервые установленным диагнозом «ВИЧ- инфекция» в возрасте от 22 до 66 лет, наблюдавшихся в ГКБ № 1 г. Новосибирска в 2021 г. Проведено исследование нуклеотидной последовательности фрагментов генома ВИЧ-1, кодирующих протеазу и обратную транскриптазу вируса, определен генотип ВИЧ-1 и выполнен анализ наличия мутаций, связанных с развитием резистентности вируса к АРП.
Результаты. В числе 119 обследованных больных ВИЧ-инфекцией преобладали мужчины – 68,1%. Доминировал половой гетеросексуальный путь передачи ВИЧ-инфекции – 61,3%. При генотипировании ВИЧ-1 у 110 больных выявлено 6 генетических вариантов ВИЧ: субтип A6 (12,7%), субтип B (1,8%), CRF63_02A6 (80,9%), CRF01_AE (1,8%), CRF02_AGFSU (0,9%) и два варианта уникальных рекомбинантных ВИЧ (URF), образованных с участием субтипа А6 и CRF63_02A6 (по 0,9%). Согласно основному перечню мутаций, подлежащих надзору за первичной резистентностью ВИЧ-1, обнаружено 16 резистентных вариантов ВИЧ-1 – у 13,4% от исследуемой группы больных. По совокупности всех выявленных мутаций (в том числе подлежащих надзору) первично резистентные варианты ВИЧ-1 выявлены в 19,3% случаев (n=23 из 119). Чаще других регистрировались изолированные мутации к препаратам из группы ННИОТ – в 61,0% (n=14 из 23); изолированные мутации к НИОТ отмечались у 21,8% (n=5 из 23), сочетание мутаций к НИОТ + ННИОТ – у 12,9% (n=3 из 23), к ИП + ННИОТ – у 4,3% больных (n=1 из 23). У пациентов с мутациями резистентности ВИЧ (n=23) наиболее часто встречалась К103N – одна (30,6%) и в сочетании с P225H или с K70T (по 4,3%). Наиболее часто высокий уровень устойчивости выявлялся к АРП группы ННИОТ – эфавирензу (7,5%) и невирапину (8,4%). Средний уровень устойчивости в единичных случаях был зарегистрирован к этравирину, рилпивирину и эфавирензу (по 0,8%).
Заключение. Среди наивных ВИЧ-инфицированных распространенность первичной резистентности ВИЧ-1 к АРТ соответствует среднему уровню для территорий России – 13,4%. Среди мутаций резистентности ВИЧ (n=23) наиболее часто встречалась К103N – одна (30,6%) и в сочетании с P225H и K70T (по 4,3%).
Литература
- World Health Organization. HIV/AIDS. URL: https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/hiv-aids (date of access – 11.03.2022).
- Parikh U.M., McCormick K., van Zyl G., Mellors J.W. Future technologies for monitoring HIV drug resistance and cure. Curr Opin HIV AIDS. 2017;12(2): 182–89. https://dx.doi.org/10.1097/COH.0000000000000344.
- Alteri C., Svicher V., Gori C. et al. Characterization of the patterns of drug-resistance mutations in newly diagnosed HIV-1 infected patients naive to the antiretroviral drugs. BMC Infect Dis. 2009; 9: 111. https://dx.doi.org/10.1186/1471-2334-9-111
- World Health Organization, United States Centers for Disease Control and Prevention, The Global Fund to Fight AIDS, Tuberculosis and Malaria. HIV drug resistance report 2017. URL: https://www.who.int/hiv/pub/drugresistance/hivdr-report-2017/en (date of access – 11.03.2022).
- Российская база данных устойчивости ВИЧ к антиретровирусным препаратам. Доступ: https://www.hivresist.ru (дата обращения – 11.03.2022).
- Fanales-Belasio E., Raimondo M., Suligoi B., Butto S. HIV virology and pathogenetic mechanisms of infection: A brief overview. Ann Ist Super Sanita. 2010; 46(1): 5–14. https://dx.doi.org/10.4415/ANN_10_01_02.
- Зайцева Н.Н., Парфенова О.В., Пекшева О.Ю. Анализ распространенности первичной резистентности ВИЧ к антиретровирусным препаратам в Приволжском федеральном округе. Медицинский альманах. 2016; 3: 93–95.
- Бобкова М.Р. Лекарственная устойчивость ВИЧ. М.: Человек. 2014; 288 с.
- Hall T.A. BioEdit: A user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucl Acids Symp Ser. 1999; 41: 95–98.
- Tamura K., Stecher G., Peterson D. et al. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. Mol Biol Evol. 2013; 30(12): 2725–29. https://dx.doi.org/10.1093/molbev/mst197.
- Tang M.W., Liu T.F., Shafer R.W. The HIVdb system for HIV-1 genotypic resistance interpretation. Intervirology. 2012; 55(2): 98–101. https://dx.doi.org/10.1159/000331998.
- Bennett D.E., Camacho R.J., Otelea D. et al. Drug resistance mutations for surveillance of transmitted HIV-1 drug-resistance: 2009 update. PLoS One. 2009; 4(3): e4724. https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0004724.
- Kirichenko A., Kireev D., Lopatukhin A. et al. Prevalence of HIV-1 drug resistance in Eastern European and Central Asian countries. PLoS One. 2022; 17(1): e0257731. https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0257731. pone.0257731
- Gashnikova N.M., Zyryanova D.P., Astakhova E.M. et al. Predominance of CRF63 02A1 and multiple patterns of unique recombinant forms of CRF63 A1 among individuals with newly diagnosed HIV-1 infection in Kemerovo Oblast, Russia. Arch Virol. 2017; 162(2): 379–90. https://dx.doi.org/10.1007/s00705-016-3120-4.
- Maksimenko L.V., Totmenin A.V., Gashnikova M.P. et al. Genetic diversity of HIV-1 in Krasnoyarsk Krai: Area with high levels of HIV-1 recombination in Russia. Biomed Res Int. 2020; 2020: 9057541. https://dx.doi.org/10.1155/2020/9057541.
Об авторах / Для корреспонденции
Дмитрий Вячеславович Капустин, к.м.н., ассистент кафедры инфекционных болезней ФГБОУ ВО «Новосибирский государственный медицинский университет» Минздрава России. Адрес: 630099, г. Новосибирск, ул. Семьи Шамшиных, д. 40, к. 4. E-mail: dmitrij_kapustin_1991@inbox.ru. ORCID: https://orcid.org/ 0000-0002-7060-4710
Елена Игоревна Краснова, д.м.н., профессор, зав. кафедрой инфекционных болезней ФГБОУ ВО «Новосибирский государственный медицинский университет» Минздрава России. Адрес: 630099, г. Новосибирск, ул. Семьи Шамшиных, д. 40, к. 4. E-mail: krasnova-inf@rambler.ru. ORCID: https://orcid.org/0000-0003-3168-9309
Максим Равильевич Халиков, стажер-исследователь отдела ретровирусов ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии Вектор» Роспотребнадзора. Адрес: 630559, р.п. Кольцово, Новосибирская область. E-mail: halikov_mr@vector.nsc.ru
Лариса Леонидовна Позднякова, к.м.н., главный врач ГБУЗ Новосибирской области «Городская инфекционная клиническая больница № 1». Адрес: 630099, г. Новосибирск, ул. Семьи Шамшиных, д. 40, к. 5. E-mail: gikb1@yandex.ru
Наталья Игоревна Хохлова, к.м.н., доцент, доцент кафедры инфекционных болезней ФГБОУ ВО «Новосибирский государственный медицинский университет» Минздрава России. Адрес: 630099, г. Новосибирск, ул. Семьи Шамшиных, д. 40, к. 4. E-mail: talitas@bk.ru
Лада Владимировна Максименко, младший научный сотрудник отдела ретровирусов ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии Вектор» Роспотребнадзора. Адрес: 630559, р.п. Кольцово, Новосибирская область. E-mail: maksimenko_lv@vector.nsc.ru. ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4273-1704.
Василий Евгеньевич Екушов, стажер-исследователь отдела ретровирусов ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии Вектор» Роспотребнадзора. Адрес: 630559, р.п. Кольцово, Новосибирская область. E-mail: ekushov_ve@vector.nsc.ru. ORCID: https://orcid.org/0000-0002-0465-1260
Алексей Владимирович Тотменин, к.б.н., ведущий научный сотрудник отдела ретровирусов ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии Вектор» Роспотребнадзора. Адрес: 630559, р.п. Кольцово, Новосибирская область. E-mail: totmenin@vector.nsc.ru. ORCID: https://orcid.org/0000-0002-7418-4872
Наталья Матвеевна Гашникова, к.б.н., зав. отделом ретровирусов ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии Вектор» Роспотребнадзора. Адрес: 630559, р.п. Кольцово, Новосибирская область. E-mail: nmgashnikova@gmail.com. ORCID: https://orcid.org/0000-0002-0891-0880
Похожие статьи