Ассоциация полиморфных маркеров в генах рецепторов врожденного иммунитета с развитием и тяжестью течения COVID-19


DOI: https://dx.doi.org/10.18565/therapy.2023.2.14-20

Н.О. Калюжная, Е.А. Меремьянина, Н.Д. Абрамова, Е.Ю. Малинникова, А.Б. Сафонова, А.Г. Чучалин, О.А. Свитич

1) ФГБНУ «НИИ вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова» Минобрнауки России, г. Москва; 2) ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России, г. Москва; 3) ФГАОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова» Минздрава России, г. Москва; 4) ФГАОУ ВО «Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова» Минздрава России (Сеченовский университет); 5) ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России, г. Москва
Аннотация. В настоящее время широкое распространение по всему миру получила новая коронавирусная инфекция (COVID-19), вызванная вирусом SARS-CoV-2. Было показано, что важную роль в иммунопатогенезе данного заболевания играют рецепторы врожденного иммунитета (в частности, NOD-подобные рецепторы и RIG-I-подобные рецепторы). Они способны влиять на экспрессию генов цитокинов и интерферонов, опосредуя запуск реакций врожденного иммунного ответа на патоген. Однако на сегодняшний день мало изучены генетические аспекты данных рецепторов.
Цель исследования – поиск и анализ ассоциаций полиморфных маркеров rs2075822 в гене NOD1, rs3135499 и rs8057341 в гене NOD2, а также rs1990760 в гене IFIH1 с развитием и тяжестью течения COVID-19.
Материалы и методы. Для проведения исследования был выполнен забор венозной крови у пациентов с разными степенями тяжести течения COVID-19, а также у здоровых индивидуумов. Из полученных образцов была выделена ДНК, после чего проведен анализ ДНК с использованием метода полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (ПЦР-РВ) на выбранные полиморфные маркеры.
Результаты. Мы установили, что маркеры rs3135499 и rs8057341 ассоциированы с заболеваемостью коронавирусной инфекцией. Кроме того, маркеры rs1990760 и rs2075822 связаны с легким течением инфекции, а rs8057341 – с течением средней тяжести.
Заключение. Полученные данные могут быть использованы в качестве предиктивных маркеров при прогнозировании тяжести течения коронавирусной инфекции у здоровых лиц с неблагоприятным анамнезом и склонностью к легочным заболеваниям, а также для раннего выявления больных, предрасположенных к тяжелому течению COVID-19, среди всех пациентов с уже развившимися клиническими проявлениями.
Ключевые слова: полиморфные маркеры, RIG-I-подобные рецепторы, SARS-CoV-2, COVID-19, NOD-подобные рецепторы, коронавирусная инфекция, врожденный иммунитет
Полный текст статьи доступен
в "Библиотеке Врача"

Литература

1. Yildirim Z., Sahin O.S., Yazar S., Bozok Cetintas V. Genetic and epigenetic factors associated with increased severity of Covid-19. Cell Biol Int. 2021; 45(6): 1158–74. https://dx.doi.org/10.1002/cbin.11572.


2. Абрамова Н.Д., Ахматова Н.К., Бишева И.В. с соавт. Мукозальный иммунитет у пациентов с COVID-19: лечение и реабилитация. Под ред. Костинова М.П., Свитича О.А., Чучалина А.Г. М.: Группа МДВ. 2022; с. 9–40.


3. Арзуманян В.Г., Быстрицкая Е.П., Колыганова Т.И. с соавт. Антимикробная активность сыворотки крови до и после вакцинации препаратом «ЭпиВакКорона». Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2022; 173(3): 350–356.


4. Khan S., Shafiei M.S., Longoria C. et al. SARS-CoV-2 spike protein induces inflammation via TLR2-dependent activation of the NF-κB pathway. ELife. 2021; 10: e68563. https://dx.doi.org/10.7554/eLife.68563.


5. Watanabe T., Kitani A., Murray P.J., Strober W. NOD2 is a negative regulator of Toll-like receptor 2-mediated T helper type 1 responses. Nat Immunol. 2004; 5(8): 800–8. https://dx.doi.org/10.1038/ni1092.


6. Al-Shobaili H.A., Ahmed A.A., Alnomair N.N. et al. Alnomair molecular genetic of atopic dermatitis: An update. Int J Health Sci (Qassim). 2016; 10(1): 96–120.


7. Loos B.G., Fiebig A., Nothnagel M. et al. NOD1 gene polymorphisms in relation to aggressive periodontitis. Innate Immun. 2009; 15(4): 225–32. https://dx.doi.org/10.1177/1753425909103739.


8. Huebner C., Ferguson L.R., Han D.Y. et al. Nucleotide-binding oligomerization domain containing 1 (NOD1) haplotypes and single nucleotide polymorphisms modify susceptibility to inflammatory bowel diseases in a New Zealand caucasian population: A case-control study. BMC Res Notes. 2009; 2: 52. https://dx.doi.org/10.1186/1756-0500-2-52.


9. Pan H., Dai Y., Tang S., Wang J. Polymorphisms of NOD2 and the risk of tuberculosis: A validation study in the Chinese population. Int J Immunogenet. 2012; 39(3): 233–40. https://dx.doi.org/10.1111/j.1744-313X.2011.01079.x.


10. Leturiondo A.L., Noronha A.B., Mendonça C.Y.R. et al. Association of NOD2 and IFNG single nucleotide polymorphisms with leprosy in the amazon ethnic admixed population. PLOS Negl Trop Dis. 2020; 14(5): e0008247. https://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0008247.


11. Xiong J.H., Mao C., Sha X.W. et al. Association between genetic variants in NOD2, C13orf31, and CCDC122 genes and leprosy among the Chinese Yi population. Int J Dermatol. 2016; 55(1): 65–69. https://dx.doi.org/10.1111/ijd.12981.


12. Li L., Yu H., Jiang Y. et al. Genetic variations of NLR family genes in Behcet’s disease. Sci Rep. 2016; 6: 20098.https://dx.doi.org/10.1038/srep20098.


13. Liu S., Wang H., Jin Y. et al. IFIH1 polymorphisms are significantly associated with type 1 diabetes and IFIH1 gene expression in peripheral blood mononuclear cells. Hum Mol Geneti. 2009; 18(2): 358–65. https://dx.doi.org/10.1093/hmg/ddn342.


14. Zurawek M., Fichna M., Januszkiewicz D. et al. Polymorphisms in the interferon-induced helicase (IFIH1) locus and susceptibility to Addison’s disease. Clin Endocrinol (Oxf). 2013; 78(2): 191–96. https://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2265.2012.04497.x.


15. Rydzewska M., Goralczyk A., Goscik J. et al. Analysis of chosen polymorphisms rs2476601 a/G–PTPN22, rs1990760 C/T–IFIH1, rs179247 a/G–TSHR in pathogenesis of autoimmune thyroid diseases in children. Autoimmunity. 2018; 51(4): 183–190.https://dx.doi.org/10.1080/08916934.2018.1486824.


16. Leite F.R.M., Enevold C., Bendtzen K. et al. Pattern recognition receptor polymorphisms in early periodontitis. J Periodontol. 2019; 90(6): 647–54. https://dx.doi.org/10.1002/JPER.18-0547.


17. Smyth D.J., Cooper J.D., Bailey R. et al. A genome-wide association study of nonsynonymous SNPs identifies a type 1 diabetes locus in the interferon-induced helicase (IFIH1) region. Nat Genet. 2006; 38(6): 617–19. https://dx.doi.org/10.1038/ng1800.


18. Sutherland A., Davies J., Owen C.J. et al. Genomic polymorphism at the interferon-induced helicase (IFIH1) locus contributes to Graves’ disease susceptibility. J Clin Endocrinol Metab. 2020; 92(8): 3338–41. https://dx.doi.org/10.1210/jc.2007-0173.


19. Enevold C., Kjaer L., Nielsen C.H. et al. Genetic polymorphisms of dsRNA ligating pattern recognition receptors TLR3, MDA5, and RIG-I. Association with systemic lupus erythematosus and clinical phenotypes. Rheumatol Int. 2014; 34(10): 1401–8.https://dx.doi.org/10.1007/s00296-014-3012-4.


Об авторах / Для корреспонденции

Наталия Олеговна Калюжная, младший научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии ФГБНУ «НИИ вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова» Минобрнауки России. Адрес: 115088, г. Москва, 1-я Дубровская ул., д. 15. E-mail: nat_kalyuzhnaya@mail.ru. ORCID: https://orcid.org/0000-0002-1668-1846
Екатерина Андреевна Меремьянина, к.м.н., научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии ФГБНУ «НИИ вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова» Минобрнауки России, старший преподаватель кафедры вирусологии ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России. Адрес: 115088, г. Москва, 1-я Дубровская ул., д. 15. E-mail: ekaterina@meremianina.ru. ORCID: https://orcid.org/0000-0003-4334-1473
Наталья Дмитриевна Абрамова, младший научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии ФГБНУ «НИИ вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова» Минобрнауки России. Адрес: 115088, г. Москва,
1-я Дубровская ул., д. 15. E-mail: and960911@gmail.com. ORCID: https://orcid.org/0000-0002-7307-0515
Елена Юрьевна Малинникова, д.м.н., доцент, зав. кафедрой вирусологии ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России. Адрес: 125445, г. Москва, ул. Беломорская, д. 19/38. E-mail: malinacgb@mail.ru. ORCID: https://orcid.org/0000-0002-5501-5707
Анна Борисовна Сафонова, ординатор ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России. Адрес: 115478, г. Москва, Каширское шоссе 24. E-mail: apotapova97@mail.ru,
ORCID https://orcid.org/0009-0000-6927-1966
Александр Григорьевич Чучалин, д.м.н., профессор, академик РАН, зав. кафедрой госпитальной терапии педиатрического факультета ФГАОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова» Минздрава России, председатель правления Российского респираторного общества. Адрес: 105077, г. Москва, 11-я Парковая ул., д. 32, к. 4. E-mail: pulmomoskva@mail.ru. ORCID: https://orcid.org/0000-0002-6808-5528
Оксана Анатольевна Свитич, д.м.н., профессор РАН, член-корреспондент РАН, директор ФГБНУ «НИИ вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова» Минобрнауки России, профессор кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии им. академика А.А. Воробьева ФГАОУ ВО «Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова» Минздрава России (Сеченовский университет). Адрес: 105064, г. Москва, Малый Казенный пер., д. 5А. E-mail: svitichoa@yandex.ru. ORCID: https://orcid.org/0000-0003-1757-8389


Похожие статьи

К содержанию номера

Бионика Медиа